Southern Blot
Southern印迹杂交(Southern blot)是1975年由英国人southern创建,是研究DNA图谱的基本技术,在遗传病诊断、DNA图谱分析及PCR产物分析等方面有重要价值。
【应用简介】
Southern印迹杂交(Southern blot)是1975年由英国人southern创建,是研究DNA图谱的基本技术,在遗传病诊断、DNA图谱分析及PCR产物分析等方面有重要价值。
【技术原理】
将待测的 DNA 样品固定在硝酸纤维膜或尼龙膜等固相上,加入标记的核酸探针进行杂交。按照碱基互补配对原则,核酸探针会与固相上的DNA同源序列进行互补,加入显色系统即能显示出杂交信号,通过检测信号的有无、强弱可以对样品定性、定量分析。
【技术应用】
1、定性及定量分析基因组中特定基因;
2、基因突变分析及限制性片段长度多态性分析。
【实验流程】
送检与交付标准
样品类型 | 样品需求 | 保存条件 | 运输条件 | 备注 |
动物组织 | 单个样品>0.1g,2mlEP管或冻存管装,不要过量;样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低,冻存样本避免反复冻融以致降解。 | -80℃ | 干冰 | 所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识 |
种子样本 | 去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 |
贴壁/悬浮细胞 | 1. 总RNA或蛋白:106cell/指标、浆/核RNA或蛋白:107cell/指标、线粒体RNA或蛋白:2*107cell/指标,样本尽量新鲜,细胞收取后直接加Trizol(QPCR检测)或直接冻存于-80℃。 2. 若细胞处理(加药、转染、感染)后状态差应酌情加大收样量。 | -80℃ | 干冰 |
全血/血清样品 | 用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白细胞匀浆>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。 | -80℃ | 干冰 |
石蜡包埋样品 | 由标准的石蜡包埋盒包埋的石蜡块,有效厚度大于 0.1cm; 新鲜的 FFPE 组织切片,每片厚度不超过 10μm,2~8 张,表面积不超过 250mm2。 | -20℃ | 冰袋 |
抗体 | 1. 按样本种属提供满足相应实验要求的抗体; 2. 按抗体说明书要求寄送,尽量避免分装;如分装,确保量足够进行实验,并提供抗体说明书。 3.保存抗体的抗体管上应有能够识别此抗体的标记,抗体的量应大于实验所需的量。 | -20℃ | 冰袋 |
引物 | 干粉,≥1OD,如进行预实验,每个基因至少提供两对引物, 附带公司引物合成单。 | -20℃ | 冰袋或常温 |