│IF:48 Nature Methods│主要染色质类型的组合单细胞分析与MAbID│IF:48 Nature Methods│主要染色质类型的组合单细胞分析与MAbID 配图： 总述：基因调控涉及多个因子在不同基因组尺度上的协同活动。染色体位于不同的核区域，这些区域被进一步划分为相似的染色质状态。基因表达程序是众多调控因子共同作用的结果。在局部范围内，DNA甲基化、组蛋白翻译后修饰(PTMs)和染色质重塑复合物协同调节转录活性。这些因素之间的相互作用最终决定了细胞的特性和功能。为了理解基因表达的调控机制，需要能够同时测量多个基因调控状态的技术。研究它们的协同作用模式对于理解基因调控是必要的，但在一个样本中同时测量这些因素一直是一个挑战。 在这里，研究人员介绍了条形码多重抗体( Multiplexing Antibodies by barcode鉴定，MAbID )，一种用于组蛋白修饰和染色质结合蛋白组合基因组预测的方法。MAbID利用抗体- DNA偶联物在抗原表位的基因组位置整合条形码，使多种抗体联合孵育可以同时揭示许多表观遗传标记的分布。使用MAbID在不损失个体数据质量的情况下，提供了主要的染色质类型和多重测量。此外，在小鼠骨髓单细胞和小鼠体外分化过程中获得了6个抗原表位的联合测量，捕获了多因子染色质状态的相关变化。因此，MAbID有可能对基因调控机制之间的相互作用获得独特的见解，特别是在低起始量样本和单细胞中。 引用文献：Lochs SJA, van der Weide RH, de Luca KL, Korthout T, van Beek RE, Kimura H, Kind J. Combinatorial single-cell profiling of major chromatin types with MAbID. Nat Methods. 2023 Dec 4. https://doi.org/10.1038/s41592-023-02090-9. |
