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│IF50.3 Cancer Cell│肠化生的时空基因组图谱揭示了胃癌进展的克隆动力学

IF50.3 Cancer Cell肠化生的时空基因组图谱揭示了胃癌进展的克隆动力学

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总述:肠上皮化生(IM)是一种与胃癌(GC)风险增加相关的胃粘膜恶性前病变。在一项为期10年的前瞻性研究中,研究人员分析了692名受试者的1256份胃样本(1152IMs),确定了26IM驱动基因,包括染色质调控(ARID1A)和肠道稳态(SOX9)。单细胞和空间剖面突出了组织生态学和IM谱系异质性的变化,包括与早期恶性肿瘤相关的肠干细胞显性细胞室。扩展的转录组分析揭示了IM的基于表达的分子亚型与不完整的组织学、胃/肠细胞类型、ARID1A突变、炎症和通常与健康口腔相关的微生物群落相关。本研究证明,联合临床基因组模型在预测IMs转化为GC的可能性方面优于仅临床模型。通过强调准确识别胃癌高风险IM患者的策略以及微生物生态失调在IM进展中的作用,这项研究结果为胃癌的精确预防和拦截提供了机会。可能与胃癌前病变患者的管理有关。与日本和韩国等胃癌发病率高到需要进行非选择性人群筛查的国家不同,在新加坡等胃癌发病率中等的国家,大规模人群筛查并不具有成本效益。作为一种替代方案,对根据不同胃癌风险模式分层的患者应用差异化筛查方法可能是一种更可持续的策略。研究结果显示,将基因组数据整合到临床风险分层模型中可以提高风险模型的准确性,这表明基因组检测在识别胃癌高危人群方面具有潜在的实用性。

引用文献:Huang KK, Ma H, Chong RHH, Uchihara T, Lian BSX, Zhu F, Sheng T, Srivastava S, Tay ST, Sundar R, Tan ALK, Ong X, Lee M, Ho SWT, Lesluyes T, Ashktorab H, Smoot D, Van Loo P, Chua JS, Ramnarayanan K, Lau LHS, Gotoda T, Kim HS, Ang TL, Khor C, Lee JWJ, Tsao SKK, Yang WL, Teh M, Chung H, So JBY, Yeoh KG, Tan P; Singapore Gastric Cancer Consortium. Spatiotemporal genomic profiling of intestinal metaplasia reveals clonal dynamics of gastric cancer progression. Cancer Cell. 2023 Dec 11;41(12):2019-2037.e8. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2023.10.004.


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