搜索
全国服务热线 020-31100174



IF 16.6 Nature communications│定量分析人类3′UTR的负选择揭示了RNA结合蛋白的受限靶标

IF:16.6 Nature communications定量分析人类3′UTR的负选择揭示了RNA结合蛋白的受限靶标

配图图片5.png

总述:在人类基因组中,很多与表型相关的非编码变异发生在三个非翻译区(3' UTRs),这些变异可能会影响RNA结合蛋白(RBPs)的相互作用,从而在转录后水平调节基因表达。然而,鉴定功能性的3' UTR变异一直是一个挑战。为了解决这一问题,研究人员采用了一种新的方法,利用基因组聚集数据库(gnomAD)中的等位基因频率来鉴定在人类中受到强负选择的3' UTR变异。研究开发了iMAPS,这是一种与多等位基因特异性选择(MAPS)相关的广义测量方法。iMAPS用于量化非编码区域的负选择程度。这种方法结合了体外和体内的结合数据,能够在受到强烈选择压力的情况下,精确地识别RNA结合蛋白(RBP)的结合位点、miRNA的靶点和聚腺苷化信号(PASs)。通过对gnomAD数据库中的数千个变异进行分析,研究发现与错义编码变体相比,最常见的PAS上游的核心3' UTR区域的位点受到了最强的选择压力。这一发现不仅揭示了特定3' UTR区域在基因表达调控中的重要性,也表明这些区域的变异可能对人类表型产生显著影响。研究通过分析大量的人类基因组数据,提高了我们对于人类基因选择过程的理解。研究方法验证了解释人类3' UTR遗传变异的一种新途径,为进一步研究3' UTR区域在疾病和表型中的作用提供了强有力的工具。此外,研究还强调了非编码区域,特别是3' UTRs,在基因表达调控中的关键作用。这些区域的变异可能影响mRNA的稳定性、翻译效率和亚细胞定位,从而在多个层面调控基因表达。因此,对这些区域的深入研究不仅有助于理解基因表达的复杂机制,也对于疾病的预防、诊断和治疗具有重要意义。

引用文献:Findlay, Scott D., Romo, Lindsay., Romo, Lindsay., Burge, Christopher B..   Quantifying negative selection in human 3' UTRs uncovers constrained targets of RNA-binding proteins. Nature communications, 2024,

DOI10.1038/s41467-023-44456-9


初源云医疗
初源云医疗专注于医学科研版块,业务涵盖细胞基因修饰、病毒包装、合成生物学、单细胞测序、蛋白质组学、基因编辑动物、药品上市后药效研究等科研技术服务和成果转化。 基石启航医疗与香港基石生物、探罕科学研究有限公司、松诺生物及香港科技大学、沈阳医学院等国内外知名机构有着深度合作关系,旨在促进资源共享和技术交流,加速研究成果的转化和应用
资讯与资源
新媒体矩阵
合作伙伴