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IF 11 Molecular Psychiatry│长链非编码RNA(lncRNA)在神经发育中的作用。

IF11 Molecular Psychiatry长链非编码RNAlncRNA)在神经发育中的作用。

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总述:lncRNAs是超过200个核苷酸的序列,它们由哺乳动物基因组的大部分转录而来。这些RNA在细胞中可能扮演多种生物学角色,包括作为miRNA内源性靶标模拟物、染色质修饰剂、支架等。lncRNAs在人类大脑中表达丰富,与多种神经发育过程密切相关。lncRNAs可以来自基因组的各个区域,包括内含子、重复元素、蛋白质编码区和3′非编码区。它们通常由RNA聚合酶II转录、选择性剪接,并在5′端加帽和/或在3′端聚腺苷酸化。多数lncRNAs被保留在核内,这可能与它们在染色质上的累积和较弱的内部剪接信号有关。lncRNAs在神经发育和病理生理学中发挥作用,但其确切机制尚不明确。核lncRNA MALAT1在突触基因表达中起调节作用,而CNS富集的lncRNA Paupar与嗅球神经发生调控有关。传统检测和分析lncRNA的方法包括平铺微阵列、串联基因表达分析、染色质免疫共沉淀和RNA测序。lncRNAs的复杂结构使得改变它们的表达成为一项挑战。基因组水平的操纵主要使用可编程核酸酶,CRISPR/Cas系统,用于高通量遗传筛选、转录干扰和基因激活。CRISPR/Cas系统已被用于多种新应用,如基因组编辑、活细胞跟踪、表观遗传修饰和基因扰动。目前也是最广泛使用和适应的CRISPR工具,设计用于靶向哺乳动物细胞。CRISPR/Cas系统被用于研究lncRNAs在神经发育中的角色,包括组织特异性和/或在特定发育阶段表达的lncRNAs。利用CRISPR/Cas9系统,研究人员在小鼠模型中研究了lncRNAs在行为表型和神经发育过程中的作用。总体而言,该研究全面阐述了lncRNAs在神经发育中的潜在作用,以及研究这些复杂RNA分子的当前方法和挑战。这些发现对于理解lncRNAs在神经生物学和临床应用中的角色至关重要

引用文献:Srinivas T, Siqueira E, Guil S. Techniques for investigating lncRNA transcript functions in neurodevelopment. Mol Psychiatry. 2023 Dec 25.


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